De dienst Financiën en begroting assisteert het personeel van Cedefop bij het voorspellen, uitvoeren en controleren van begrotingskredieten. De dienst verzorgt de interne en externe verslaglegging over financiële en budgettaire aangelegenheden. Verder zorgt de dienst voor de gecentraliseerde financiële verificatie van alle transacties in het kader van de jaarlijkse begroting (circa 18 miljoen EUR in de afgelopen jaren). De begroting wordt nagenoeg geheel gefinancierd met middelen van de Europese Unie.