A pénzügyi és költségvetési szolgálat támogatja a Cedefop munkatársait a költségvetési előirányzatok előrejelzésében, végrehajtásában és ellenőrzésében. Gondoskodik a pénzügyi és költségvetési vonatkozású kérdésekről szóló belső és külső jelentésekről. Biztosítja ezenkívül az utóbbi években nagyjából 18 millió eurós, szinte kizárólag európai uniós alapokból finanszírozott éves költségvetés terhére végzett összes tranzakció központosított pénzügyi ellenőrzését.