O Serviço de Finanças e Orçamento presta apoio ao pessoal do Cedefop em termos de previsão, execução e acompanhamento das dotações orçamentais. É ele que elabora os relatórios internos e externos sobre questões financeiras e orçamentais, além de assegurar um controlo financeiro centralizado de todas as operações executadas com base num orçamento anual que, nos últimos anos, ronda os 18 milhões de euros e é quase exclusivamente financiado por fundos da União Europeia.